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如何用R语言ggplot2画小提琴图
如何用R语言ggplot2画小提琴图，针对这个问题，这篇文章详细介绍了相对应的分析和解答，希望可以帮助更多想解决这个问题的小伙伴找到更简单易行的方法。
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今天推文的主要内容是介绍如何使用R语言绘制散点图并且添加拟合曲线和置信区间
补充材料Fig9 小提琴图
数据格式如下
需要示例数据可以直接在文末留言
df<-read.csv("Single_Cell/violineplot-1.csv",header=T)
colnames(df)
head(df)
library(ggplot2)
#help(package="ggplot2")
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+
geom_violin()
去掉灰色背景 去掉网格线 添加坐标轴的线
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+
geom_violin()+
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.line = element_line())
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+
geom_violin()+
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.line = element_line(),
axis.text.x = element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5))
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+
geom_violin()+
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.line = element_line(),
axis.text.x = element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5))+
labs(x=NULL,
y=NULL,
title = "Complexity")
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+
geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend = F)+
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.line = element_line(),
axis.text.x = element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5))+
labs(x=NULL,
y=NULL,
title = "Complexity")
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+
geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend = F)+
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.line = element_line(),
axis.text.x = element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5))+
labs(x=NULL,
y=NULL,
title = "Complexity")+
geom_jitter(size=0.5)
这样的话论文中的图就复现出来了。上图叠加的散点图是矩形的，最近看到一个函数
geom_sina()可以让散点图也以小提琴的形状显示，我们试一下用这个函数的效果，这个函数来自ggforce这个包，使用前需要先加载
library(ggforce)
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+
geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend = F)+
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.line = element_line(),
axis.text.x = element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5),
plot.title = element_text(hjust=0.5))+
labs(x=NULL,
y=NULL,
title = "Complexity")+
geom_sina(size=0.1,alpha=0.2)
这样看起来比论文中的图好像好看一点
关于如何用R语言ggplot2画小提琴图问题的解答就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，如果你还有很多疑惑没有解开，可以关注创新互联行业资讯频道了解更多相关知识。
分享名称：如何用R语言ggplot2画小提琴图
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