重庆分公司
重庆分公司，新征程启航
为企业提供网站建设、域名注册、服务器等服务
java中如何查看重复的DNA序列
本文将为大家详细介绍“java中如何查看重复的DNA序列”，内容步骤清晰详细，细节处理妥当，而小编每天都会更新不同的知识点，希望这篇“java中如何查看重复的DNA序列”能够给你意想不到的收获，请大家跟着小编的思路慢慢深入，具体内容如下，一起去收获新知识吧。
成都创新互联公司是一家专注于网站建设、成都网站制作与策划设计,萝北网站建设哪家好?成都创新互联公司做网站,专注于网站建设十多年,网设计领域的专业建站公司;建站业务涵盖:萝北等地区。萝北做网站价格咨询:13518219792
所有 DNA 由一系列缩写为 A，C，G 和 T 的核苷酸组成，例如：“ACGAATTCCG”。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。
编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超过一次的10个字母长的序列（子串）。
示例:
输入: s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
输出: ["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"]答案：
1public List findRepeatedDnaSequences(String s) {
2 Set seen = new HashSet();
3 Set repeated = new HashSet();
4 for (int i = 0; i + 9 < s.length(); i++) {
5 String ten = s.substring(i, i + 10);
6 if (!seen.add(ten))
7 repeated.add(ten);
8 }
9 return new ArrayList(repeated);
10}
解析：
意思是每次截取10个字符的子串，并且这种字串出现的次数超过一次，代码很简单，每次截取的时候都会存放到seen集合中，如果存放失败，表示出现了重复，再来看一种写法
1public List findRepeatedDnaSequences(String s) {
2 Set words = new HashSet<>();
3 Set repeated = new HashSet<>();
4 char[] map = new char[26];
5 //map['A' - 'A'] = 0;
6 map['C' - 'A'] = 1;
7 map['G' - 'A'] = 2;
8 map['T' - 'A'] = 3;
9 for (int i = 0; i < s.length() - 9; i++) {
10 int v = 0;
11 for (int j = i; j < i + 10; j++) {
12 v <<= 2;
13 v |= map[s.charAt(j) - 'A'];
14 }
15 if (!words.add(v)) {
16 repeated.add(s.substring(i, i + 10));
17 }
18 }
19 return new ArrayList(repeated);
20}
这种解法和第一种其实原理都是一样的，只不过这里存储的是一个int类型，因为0,1,2,3分别表示的是ACGT，int类型的每两位用来存储ACGT中一个，我们还可以每3位存储，最多也就是30位，小于int类型的32位，就是把下面第12行的v<<=2改为v<<=3。但不能每4位存储，因为这样超过了int的范围。
java基本数据类型有哪些
Java的基本数据类型分为：1、整数类型，用来表示整数的数据类型。2、浮点类型，用来表示小数的数据类型。3、字符类型，字符类型的关键字是“char”。4、布尔类型，是表示逻辑值的基本数据类型。
如果你能读到这里，小编希望你对“java中如何查看重复的DNA序列”这一关键问题有了从实践层面最深刻的体会，具体使用情况还需要大家自己动手实践使用过才能领会，如果想阅读更多相关内容的文章，欢迎关注创新互联行业资讯频道！
标题名称：java中如何查看重复的DNA序列
浏览路径：http://cqcxhl.cn/article/popsss.html